1. Lãnh đạo Bệnh viện: Gồm Giám đốc và không quá 02 phó giám đốc.
2. Các Phòng/khoa thuộc bệnh viện (gồm 15 phòng/khoa):
2.1. Các Phòng chức năng:
- Phòng Tổ chức – Hành chính
- Phòng Kế hoạch – Tổng hợp;
- Phòng Chỉ đạo tuyến ;
- Phòng Tài chính – Kế toán;
- Phòng Điều dưỡng;
2.2. Các khoa:
- Khoa khám bệnh;
- Khoa Cấp cứu – Hồi sức tích cực và chống độc
- Khoa Bệnh phổi – Phục hồi chức năng – Vật lý trị liệu
- Khoa Lao ngoài phổi
- Khoa Lao phổi
- Khoa Lao - HIV- Kháng thuốc;
- Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn;
- Khoa Dược – Vật tư y tế;
- Khoa Dinh dưỡng;
- Khoa Cận lâm sàng (xét nghiệm, chẩn đoán hình ảnh và thăm dò chức năng hô hấp).